عملکرد مبتنی بر توالی روش اجازه تجزیه و تحلیل فقط یک تک سلولی باکتری ها

IMAGE

تصویر: طراحی از خشم تراشه مشاهده بیشتر

اعتبار: XU Teng

یک تابع جدید مبتنی بر توالی روش استفاده از انبرک نوری و با استفاده از خواص گرانش است که اجازه محققان باکتری های تجزیه و تحلیل سلول های یک به یک است. مطالعه انجام شده توسط محققان از چینگدائو موسسه انرژی زیستی و Bioprocess تکنولوژی (QIBEBT) از آکادمی چینی علوم منتشر شد در کوچک در ژوئن 9.

باکتری ها و سلول های بسیار کوچک کوچک است که از آن شده است بسیار دشوار است برای تجزیه و تحلیل فقط یک سلول باکتری و یا باکتری در یک زمان. به عنوان یک نتیجه بسیاری از آنها گاهی اوقات میلیون ها نفر در یک زمان باید به تجزیه و تحلیل به طور همزمان. این به ما می گوید زیادی در مورد این گروه به عنوان یک کل است, اما آن را مانع از محققان را قادر به بررسی ارتباط بین یک باکتری را ژنوتيپ و یا مجموعه ای کامل از ژن و آن فنوتیپ یا مجموعه ای از ویژگی های است که نتیجه از تعامل آن ژن و محیط زیست است.

یک راه ساده برای فکر کردن در مورد تمایز بین ژنوتیپ و فنوتیپ است به یاد داشته باشید که در حالی که یک واحد ذرت گیاه ژنوتیپ ممکن است اجازه می دهد آن را به رشد سه فوت قد و اگر نه مقدار کود اعمال می شود و سپس ذرت گیاه فنوتیپ ممکن است که آن را تنها به رشد بود دو پا بلند است.

تجزیه و تحلیل ارتباط بین ژنوتیپ و فنوتیپ ساده است این موجود زنده و بسیار مفید بیش از حد.

مشابه بینش در مورد ژنوتيپ-فنوتيپ ارتباط از یک باکتری نیست حداقل با توجه به بیماری های عفونی را به دنبال شده است اما مانع توسط یک باکتری است که به طور معمول فقط چند میلیونیم یک متر در طول.

محققان از تک سلولی مرکز در QIBEBT را توسعه داده اند یک باکتری-پروفایل تکنیک به نام رامان فعال جاذبه محور تک سلول ها با یگدیگر و توالی یا خشم توالی. در این روش فنوتیپ سلول های انفرادی در حال تجزیه و تحلیل یک به یک و سپس با دقت بسته بندی شده در یک picoliter microdroplet’ (یک تریلیونیم یک لیتر) است که صادر شده و نمایه شده در یک سلول در هر لوله آزمایش شیوه ای آماده برای توالی ژن بعد از آن.

این فرآیند شامل یک خشم “تراشه” از دو لایه کوارتز با یکدیگر پیوند می خورند و باید یک ورودی سوراخ چاه نفت و میکرو کانال اچ به آنها. ‘موچین نوری’ و یا بسیار متمرکز پرتو لیزر است که تولید جذاب یا دافعه نیروی دستکاری باکتری در مایع از طریق این کانال با کمک گرانش است.

فرم و ساختار و متابولیک ویژگی های باکتری – اساسا آن فنوتیپ – سپس بررسی از طریق تشخیص پنجره با استفاده از طیف سنجی رامان’ یک روش تحلیلی است که سوء استفاده از برهمکنش نور با پیوندهای شیمیایی در مواد.

“در نهایت باکتری است محصور در microdroplet است که پس از انتقال به یک لوله برای توالی ژن یا کشت سلول” گفت: پروفسور. MA بو, مربوط, نویسنده مطالعه است.

این microdroplet بسته بندی بسیار مهم است به عنوان آن اجازه می دهد تا مقدار بسیار کمی از DNA در یک سلول باکتری به تقویت بسیار حتی راه یک چالش کلیدی برای رمزگشایی ژنوم آن به طور کامل با توجه به زو Teng یک دانشجوی کارشناسی ارشد در تیم توسعه یافته است که روش.

“ما قادر به به طور مستقیم از نمونه ادرار به دست آوردن مقاومت آنتی بيوتيکی امکانات و اساسا کامل ژنوم توالی به طور همزمان از دقیقا یک سلول. این ارائه می دهد بالاترین رزولوشن ممکن است برای باکتریایی تشخیص و درمان مواد مخدر” گفت: پروفسور زو جیان دیگر نویسنده مسئول از مطالعه.

بر اساس این فناوری محققان توسعه داده اند یک ابزار به نام CAST-R برای حمایت از سریع آنتی بیوتیک های انتخاب و توالی ژنوم از پاتوژن ها همه در سطح یک سلول. این ابزار وسیله بسیار سریع تر و دقیق تر درمان با آنتی بیوتیک و حساسیت بسیار بالاتری در ردیابی و مبارزه با باکتریایی, مقاومت به آنتی بیوتیک است که یک تهدید عمده برای آینده جامعه انسانی است.

###

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! مسئول صحت اخبار منتشر شده به EurekAlert! با کمک موسسات و یا برای استفاده از هر گونه اطلاعات از طریق EurekAlert سیستم.

tinyurlis.gdclck.ruulvis.netshrtco.de