در مقیاس بزرگ تجزیه و تحلیل پروتئین آرژنین متیلاسیون توسط اسپکترومتری جرمی

متیلاسیون (یعنی علاوه بر این از یک گروه متیل) از آرژنین اسید آمینه باقی مانده از پروتئین است که پس از ترجمه اصلاح (PTM) کاتالیز توسط یک خانواده نه نفره به نام آنزیم پروتئین آرژنین متیل-Transferases (PRMTs).

PRMTs شده اند به دست آوردن افزایش توجه در علمی چشم انداز با توجه به نقش آنها در چندین ضروری فرایندهای فیزیولوژیکی و مفهوم در بیماریهای مختلف از جمله سرطان و اختلالات عصبی; از دست دادن PRMT1 کشنده است در اوایل مراحل نمو در حالی که بيان اغلب مشاهده شده در های مختلف انواع تومور و ارتباط ضعیف پیش آگهی بیمار نشان می دهد که مهار PRMTs ممکن است نشان دهنده یک روش درمانی موثر در سرطان. علاوه بر این PTM سطح مقرراتزدایی های مختلف انواع تومور و هر دو محلی و تغییرات جهانی در PTM از DNA مرتبط با پروتئین های - هیستونها - مرتبط به اسکلروز جانبی آمیوتروفیک. با توجه به حجم زیادی از شواهد علمی نشان می دهد نقش خود را در سلول پاتوفیزیولوژی چند PRMT بازدارنده های طراحی شده و توسعه یافته به عنوان یک پتانسیل کلاس جدید از مواد مخدر. برای مثال یک قوی برگشت نوع من PRMT بازدارنده نشان داده شده است که ضد اثر تومور در سرطان انسانی و مدل های برخی از مولکولی نامزدها باید وارد آزمایش های بالینی برای تومورهای جامد و لنفوم.

"اگر چه آن را برای اولین بار شرح داده شده در سال 1968 می گوید:" Dr Tiziana Bonaldi گروه رهبر در موسسه اروپایی انکولوژی "برای تقریبا 30 سال کمتر شناخته شده در مورد میزان پروتئین آرژنین متیلاسیون اثر آن بر پروتئين و فعالیت زیستی آن نقش است. اولین PRMT قادر به تسریع آرژنین متیلاسیون کشف شد و در سال 1996 و از آن پس نه پروتئین اعمال همان توابع کشف شده است. اما ناکارآمد تحلیلی روش تا حد زیادی محدود به یک درک جامع از عملکرد بیولوژیکی. کمی اسپکترومتری جرمی پدید آمده است به عنوان ایده آل تحلیلی استراتژی برای بررسی میزان پروتئین آرژنین-متیلاسیون در مدل سیستم و شناسایی PRMT اهداف نتیجه کمک قابل توجهی دانش در این زمینه است."

در مقاله منتشر شده در زمان پروتئین و پپتید علم, Dr. Bonaldi و همکاران ارائه یک مرور کلی در دولت از هنر آرژنین متیل-پروتئوميکس توصیف نوآوری است که رهبری از توضیحات by Mathias مان گروه اول با کیفیت بالا متیل-پروتئوم در سال 2004 به آخرین مطالعات که مشخصات پروتئین-متیلاسیون حوادث رخ داده و صدها نفر از تلفن همراه پروتئین است. در طول این بررسی نویسندگان توصیف پیاده سازی هر دو در روش های بيوشيميايی و در روشهای محاسباتی برای اسپکترومتری جرمی تجزیه و تحلیل داده ها و یا شناسایی سایت های آرژنین متیلاسیون بحث در مورد جوانب مثبت و منفی از رایج ترین استراتژی های شاغل.

بعلاوه مربوط به مسائل مربوط به پروتئین-آرژنین متیلاسیون تجزیه و تحلیل است که هنوز هم در حال توسعه نیز مورد بحث مانند تبعیض متقارن و نامتقارن آرژنین-di-متیلاسیون از اسپکترومتری جرمی تکه تکه شدن طیف. "این دو تغییرات باید یکسان توده در عین حال آنها کاتالیز مختلف PRMTs و قابل ملاحظه ای متفاوت بیولوژیکی نتایج" توضیح می دهد که Bonaldi; "در واقع حتی اگر مثلا هر دو نقش مهمی در تنظیم رونویسی در حالی که نامتقارن دی متیلاسیون است فعال متقارن دی متیلاسیون سرکوبگر است. بنابراین قادر به تمایز بین این دو فرایند بسیار مهم است."

در نهایت تاکید اصلی اختصاص داده شده است به سنگین متیل SILAC استراتژی تنوع بیشتر مرسوم SILAC (ایزوتوپ پایدار برچسب با اسیدهای آمینه در کشت سلولی). "سنگین متیل SILAC استراتژی طراحی شده برای افزایش اعتماد به نفس در داخل بدن آرژنین متیل-پپتید شناسایی توسط اسپکترومتری جرمی" -- ادامه Bonaldi - "و استفاده خواهد بود و تسهیل توسعه های اخیر از ad hoc الگوریتم های طراحی شده برای پردازش های سنگین متیل SILAC داده مانند MethylQuant و hmSEEKER."

از همه نویسندگان نتیجه گیری کرد که بهینه سازی در حال حاضر در دسترس تحلیلی روش و سیستماتیک برنامه را یک نقش کلیدی در تحقیقات آینده در دخالت پروتئین متیلاسیون در فرآیندهای بیولوژیکی ارائه بینش انتقادی مربوط به زیست شناسی سلولی و فرآیندهای احتمال ارائه پتانسیل رمان اهداف به بهره برداری بالينی زمینه.

###

برای دریافت متن کامل مقاله لطفا به لینک زیر: http://www.eurekaselect.com/181344/مقاله

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! مسئول صحت اخبار منتشر شده به EurekAlert! با کمک موسسات و یا برای استفاده از هر گونه اطلاعات از طریق EurekAlert سیستم.