St. Jude ابر پورتال گسترش دسترسی به گنجینه ای از کودکان تومور جامد داده

نوآورانه و تعاملی مبتنی بر ابر داده ها پورتال عرضه این هفته است که اجازه می دهد تا محققان دانشگاهی معدن بزرگترین و جامع ترین مجموعه از منابع علمی برای تحصیل کودکان تومورهای جامد و مرتبط با زیست شناسی. دوران کودکی تومور جامد شبکه (CSTN) اطلاعات پورتال در سنت جود Cloud ایجاد شده به منظور بهبود دسترسی به اطلاعات دقیق در دسترس از طریق شبکه تحریک تحقیق و توسعه از رمان نجات بخش درمان.

این CSTN شامل گسترده اطلاعات در 170 بیمار مشتق شده از نمونه به نمایندگی از 21 مختلف دوران کودکی تومورهای جامد از جمله neuroblastoma, rhabdomyosarcoma و نادر تومور. نمونه ها orthotopic بیمار مشتق شده xenografts معنی انسان نمونه تومور کاشته می شود و رشد کرده و در محل مربوطه در موش سوری.

این CSTN شامل گسترده اطلاعات در 170 بیمار مشتق شده از نمونه به نمایندگی از 21 مختلف دوران کودکی تومورهای جامد از جمله neuroblastoma, rhabdomyosarcoma و نادر تومور. نمونه ها orthotopic بیمار مشتق شده xenografts معنی انسان نمونه تومور کاشته می شود و رشد کرده و در محل مربوطه در موش سوری.

تومور و نمونه ها و اطلاعات مربوط به مشترک با محققان دانشگاهی بدون پرداخت هزینه و بدون تعهد به همکاری. مایکل دایر دکتری صندلی از سنت جود توسعه دپارتمان نوروبیولوژی و آلبرتو Pappo, M. D., St. Jude انکولوژی راه اندازی شبکه در سال 2013. هدف این بود برای سرعت بخشیدن به نوآوری در این زمینه است. "وجود نداشته است هیچ بهبود قابل توجهی در نتایج برای کودکان مبتلا به تومورهای جامد در سه دهه گذشته گفت:" دایر است که یک Howard Hughes Medical Institute محقق شده است. کودکان تومورهای جامد در حال رشد و نمو تومورهای. برای درک چگونگی این تومور شروع به رشد می کند و گسترش آنها نیاز به مطالعه در محیط که در آن آنها را توسعه دهد.

"به عنوان مورد علاقه در شبکه رشد, ما متوجه دانشمندان نیاز به حفاری عمیق تر به اطلاعات" دایر گفت. "ما ایجاد تعاملی مرورگر را که ممکن است." این CSTN اطلاعات پورتال رونمایی شد این هفته در نشست سالانه انجمن آمریکایی تحقیقات سرطان برگزار شده بود تقریبا.

داده های مبتنی بر وب

پورتال باعث می شود آن را آسان تر برای محققان برای دانلود و تجزیه و تحلیل داده های خود را.

اطلاعات موجود و ابزارهای تحلیلی عبارتند از:

• نسل بعدی کل توالی ژنوم بیمار تومور germline و orthotopic بیمار مشتق شده xenografts. این ارائه شده به عنوان برنامه های تعاملی اجازه می دهد برای سفارشی heatmaps به نمایندگی از جهش و فردی ژن جستجو. خام توالی های ژنومی نیز آپلود شده و در دسترس است.
• تعاملی مرورگرهای برای اپی ژنتیک و در برخی موارد proteomic داده
• بافت شناسی تصاویر با بافت خاص لکه ها و ميکروسکوپ الکترونی عبوری در سه magnifications برای هر نمونه
• پايه و تحلیل همسان نمونه های بیمار و orthotopic xenografts
• نمونه در سطح جستجو و تجسم خصوصیات خاص داده است که به کاربران اجازه فیلتر توسط عواملی مانند سن بیمار در تشخیص اولیه و یا در مقابل عود تومور

فارماکوکینتیک بالینی گزارش تومور انتشار پروتکل ها و بیشتر

تک سلولی توالی RNA از بیمار و بیمار مشتق-orthotopic xenografts در جریان است. اضافی تومور نمونه ها و داده های اضافه شده به شبکه به عنوان تبدیل شدن آنها در دسترس است.

محققان دانشگاهی همچنین می توانید درخواست cryopreserved سلول از orthotopic بیمار مشتق شده xenografts به عنوان به خوبی به عنوان تازه منجمد بافت یا سلول ها و در فرمالين پارافينی بافت بلوک.

همانطور که از ماه ژوئن سال 2020 بیش از 200 محققان از بیش از 100 موسسات در سراسر جهان درخواست کرده اند و با دریافت بیش از 1500 نمونه تومور از شبکه.

"ما احساس می کنیم شبکه و داده ها پورتال و بهترین راه برای اطمینان بیشتر از نمونه بافت تومور است که کودکان و پدر و مادر خود را اهدا کرده اند به ارائه منابع به سرعت درمان و درک بیماری" گفت: Asa Karlstrom دکتری از رشد و نمو نوروبیولوژی. او همکاری نویسنده اول یک گزارش در شبکه داده های پورتال که شامل یک AACR پوستر جلسه.

###

St. Jude children's Research Hospital

St. Jude children's Research Hospital است که منجر به راه جهان را درک رفتار و درمان سرطان دوران کودکی و دیگر بیماری های تهدید کننده زندگی. آن است که تنها موسسه ملی سرطان-تعیین مرکز جامع سرطان تنها اختصاص به کودکان است. درمان های توسعه یافته در سنت جود کمک کرده اند با فشار به طور کلی سرطان دوران کودکی, نرخ زنده ماندن از 20 درصد به 80 درصد از بیمارستان افتتاح بیش از 50 سال پیش است. St. Jude آزادانه سهام پیشرفت آن را می سازد و هر کودک را نجات داد در سنت جود به معنی پزشکان و دانشمندان در سراسر جهان می توانید با استفاده از این دانش برای نجات هزار نفر بیشتر از کودکان است. خانواده هرگز دریافت صورتحساب از سنت جود برای درمان, سفر, مسکن و مواد غذایی -- چرا که همه از یک خانواده باید به نگرانی در مورد کمک به کودک خود را زندگی می کنند. برای کسب اطلاعات بیشتر مراجعه کنید stjude.org یا پیروی از سنت جود در رسانه های اجتماعی در @stjuderesearch.

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! مسئول صحت اخبار منتشر شده به EurekAlert! با کمک موسسات و یا برای استفاده از هر گونه اطلاعات از طریق EurekAlert سیستم.