یک نقش جدید برای کوچک لینکر در transmembrane کانال های یونی

امهرست جرم است. - در مولکولی در سطح جهانی از کانال های یونی - معابر از طریق غشاء که حمل سیگنال در یک سلول با محیط و اجازه می دهد آن را به پاسخ دادن - محققان بحث در مورد نقش یک قطعه کوچک از این کانال به نام یک لینکر می گوید محاسباتی biophysicist Jianhan چن در دانشگاه ماساچوست امهرست.

لینکر ارتباط بین منافذ و محیط زیست-سنجش از دستگاه و دانستن عملکرد آن - که آیا آن را بی اثر و یا نقش فعال سنجش نقش شده است مشخص نیست. اما ممکن است منجر به یک هدف جدید برای مقابله با مواد مخدر و درمان در شرایط مانند فشار خون بالا, اوتیسم, صرع و سکته مغزی و آسم او می افزاید. در حال حاضر چن و همکارانش در دانشگاه واشنگتن گزارش در eLife که آزمایش های خود را نشان داد "برای اولین بار مستقیم به عنوان مثال از چه غیر خاص غشاء تعامل کووالانسی لینکر می توانید تنظیم فعال بیولوژیکی یون کانال."

به طور خاص چن و co-اولین نویسندگان مهدیه یزدانی و Zhiguang جیا در UMass Amherst با co-اولین نویسنده Guohui Zhang Jingyi شیعه و Jianmin Cui در دانشگاه مورد مطالعه منافذ به نام بزرگ-رسانش پتاسیم (BK) کانال. مهم این است که در عضلات و نورون عملکرد و کنترل غلظت کلسیم از طریق کلسیم-سنجش دامنه. آن را نیز کنترل پتانسیل الکتریکی از طریق یک ولتاژ-سنجش دامنه. آن را باز و بسته مانند یک دروازه - "واقعا رایج معماری در transmembrane گیرنده و کانال" چن می گوید.

یک واحد کوچک "C-لینکر" متصل BK کلسیم سنسور و منافذ و تا به حال اعتقاد بر این بود تا حد زیادی بی اثر اتصال. برای مطالعه این چن می گوید: "رویکرد سنتی اگر شما مشکوک به یک موقعیت خاص از پروتئین مهم است این است که برای تغییر دادن آن را و ببینید چه اتفاقی می افتد. شما جای یک اسید آمینه با یکی دیگر از. اما با این روش شما می تواند در نهایت مختل بسیاری از چیزهایی که آن را سخت به بگویید که چه شما انجام داده ایم."

در عوض محققان درهم C-لینکر اسید آمینه دنباله بسیاری از بار. "اگر شما به اندازه کافی انجام شود شما ایجاد بسیاری از افکت های مختلف که شما می توانید به طور متوسط آنها را. اگر تابع نیست تغییر کرده و همه تکرار نگاه اساسا همان چیزی خواهد ایستادگی کردن" چن یادداشت ها. "این را نیز به شما پاک کردن پس زمینه به طوری که شما می توانید برخی از زور و یا نوع تعامل که لینکر ممکن است درگیر می شود."

آنها کشف کردند که تکاپوی لینکر به طور چشمگیری تحت تاثیر قرار BK, فعال سازی, حمایت از این تصور که لینکر است که بیش از یک اثر اتصال او می افزاید. جای تعجب محاسباتی تجزیه و تحلیل پیش بینی شده است که آن را غیر اختصاصی لینکر-غشاء تعاملات نمی سنسور یا منافذ است که منجر به کانال های مختلف خواص.

برای تست این حالت جدید از کانال مقررات ژانگ در دانشگاه واشنگتن انجام شده "دو واقعا زیبا آزمایش" چن می گوید. او ساخته شده است یک نسخه کوتاه تر از کانال بدون کلسیم حسگر اما ترک آن ولتاژ-سنجش عملکرد دست نخورده است. "اگر ما فرضیه درست است در این ساخت لینکر تقلا می گذارد این کانال کوتاه در یک مد مشابه به عنوان در تمام طول کانال. و اگر لینکر می کند واکنش نشان می دهند بدون کلسیم دامنه وجود دارد لینکر است که در تعامل با چیز دیگری است."

که ثابت می شود در این مورد. بیشتر آنها در زمان یکی از تکاپوی جهش و حذف "غشاء-مهار" بخش که در تعامل با غشاء او می گوید. "ما نشان می دهد که این تنها تغییر به طور کامل معکوس لینکر تکاپوی اثر است. این یکی خاص مهار قطعه مسئول کاربردی تفاوت ما مشاهده شده است."

علاوه بر پیشرفت دانش چن توضیح می دهد که بخش مهمی از این کشف مربوط به بسیاری از دامنه های دیگر-به-دامنه linkers در پروتئین های غشاء و فرآیندهای غشایی. "در حال حاضر ما واقعا باید در نظر بگیرید که لینکر خود را بخشی از سنجش از دستگاه به جای فقط یک اتصال. این یک راه جدید به فکر می کنم در مورد آن. مطالعه ما واقعا استدلال قوی که لینکر خیلی مهم تر از برخی از مردم فکر می کردند."

او می افزاید: "ما نمی بحث در مورد یک برنامه مستقیم به بیماری های, اما این مقاله ارائه می دهد بینش مهم. ما فکر می کنیم آن را به جرقه دیگران به انجام بیشتر. آن می تواند به ارائه یک راه جدید برای طراحی داروهای چرا که در حال حاضر شما همچنین می توانید در مورد فکر می کنم و همچنین هدف قرار دادن لینکر نه تنها سنجش دامنه یا منافذ خود را. آن را به شما می دهد یک احتمال است."

###

این کار با حمایت دو NIH کمک های مالی به چن و محاسبات انجام شده در پیکس خوشه ای در ماساچوست سبز با عملکرد بالا محاسبات مرکز.

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! مسئول صحت اخبار منتشر شده به EurekAlert! با کمک موسسات و یا برای استفاده از هر گونه اطلاعات از طریق EurekAlert سیستم.