DNA شگفتی رویه در اقیانوس اطلس: گونه دور از معمول خود را در جنوب خانه

DNA دانشمندان در بررسی های جدید زندگی دریایی الگوهای مهاجرت در اقیانوس اطلس ظاهر ژنتیکی اثری از گونه دور از معمول خود را در جنوب خانه.

یک گونه از ری -- برزیل cownose ری Rhinoptera brasiliensisو خلیج فارس kingfish, Menticirrhus littoralisاند تبدیل شده اند تا هنگامی که نوبت آب و هوا گرم و در نیوجرسی Barnegat ورودی حدود دو ساعت رانندگی در جنوب شهر نیویورک است.

ری هرگز قبل از ثبت شده در ایالات متحده در شمال خلیج مکزیک; قرار گرفتن مانند خلیج فارس kingfish هرگز قبل از ثبت شده در شمال خلیج Chesapeake Virginia حدود 250 مایل (400 متر) به سمت جنوب.

رهبری خوانده شده را علامت Stoeckle از دانشگاه راکفلر و منتشر شده در مجله Frontiers در علوم دریایی, مطالعه درگیر نقشه کشی آب دریا ماهانه دو بار به مدت دو سال و آن را برای تست مواد ژنتیکی -- DNA موجود در سلول های sloughed کردن لزج ژلاتینی پوشش بیرونی از یک ماهی که در آن شنا می کند برای مثال در آن ترشحات در بافت قطعات ریخته در مبارزه با یک درنده یا پس از مرگ و یا آسیب.

دکتر Stoeckle توضیح می دهد که DNA تنزل چرخید و در عرض چند روز از یک حیوان خروج اما همچنان در آب با وجود جریانات جزر و مد به اندازه کافی بلند برای شناسایی یک گونه عبور از حضور.

بیش از دو سال از بهار سال 2017 به بهار 2019 نمونه برداری انجام شد در یک جفت از Barnegat ورودی NJ سایت در عرض چند مایل از یکدیگر -- بیرونی ساحل به نمونه آبهای اقیانوس اطلس و در داخل خلیج پناه.

در سال 2010 یک سرشماری زندگی دریایی برنامه آینده از حیوانات دریایی جمعیت (FMAP), پیش بینی تغییرات در تنوع گونه های دریایی بر اساس در دسترس زیستگاه و تغییرات پیش بینی شده در درجه حرارت آب.

جسی Ausubel مدیر برنامه محیط زیست انسانی در دانشگاه راکفلر و CoML بنیانگذاران می گوید برزیل cownose ری یا خلیج فارس kingfish, far north, شناخته شده آن محدوده متناسب با FMAP پیش بینی در حالی که اشاره کرد که توضیحات دیگر باقی می ماند ممکن است. برای مثال ممکن است حیوانات به سادگی طفره رفت نیوجرسی تورهای ترال برای سال.

با تغییرات در اقیانوس ها با توجه به آب و هوا شیمیایی و آلودگی باقی مانده و سر و صدا در شب و نور و دیگر عوامل آقای Ausubel تنش "این مطالعه بیشتر برقرار آبزیان محیط زیست DNA (ادنا) به عنوان ابتکاری و ارزان قیمت و کم اثر راه برای نظارت بر زندگی دریایی مهاجرت تغییر محدوده تنوع و توزیع است."

می گوید: دکتر Stoeckle: "امیدوار کننده کار نیز در حال انجام برای تایید ارتباط بین غلظت یک گونه' DNA در آب دریا و فراوانی گونه که در آب است. اگر نمونه های آب می تواند یک شاخص تعداد و وزن کل ماهی از گونه های داده در یک تعریف اقیانوس منطقه ارائه می دهد که پتانسیل جهش رو به جلو برای پایدار شیلات و اقیانوس مدیریت بهبود عقلانیت است که با ماهی سهمیه تنظیم شده و با کیفیت و قابلیت اطمینان از نظارت بر خود را در اطراف جهان است."

تونی مک دونالد, مدیر Monmouth University شهری ساحل موسسه کمک کرد که شروع به کار می افزاید: "Censusing دریایی ماهی و سایر حیوانات است که حرکت می کند به طور معمول شامل پر هزینه و وقت گیر نظرسنجی با تجهیزات تخصصی و پرسنل. ادنا علم اعطای بشریت بسیار قدیمی آرزو: یک راه آسان برای برآورد توزیع و فراوانی متنوع گونه های ماهی و دیگر اشکال زندگی آبزیان در آب های رودخانه ها و دریاچه ها و دریاها."

دکتر Stoeckle کار کرده است که با دبیرستان و دانشجویان به مطالعه بندر نیویورک و رودخانه هادسون اضافه می کند که "فرآیند جمع آوری به اندازه کافی ساده است برای نظارت دانش آموزان و یا دانشمندان شهروند در هر کست در هر نقطه برای کمک به نظارت بر تغییر محدوده از تمام زندگی دریایی." همکاری نویسنده Mithun دس Mishu پیوست این پروژه زمانی که او دانشجوی سال دوم در کالج هانتر.

پس از آب کشیده شده است آن فیلتر شده است به تمرکز بر روی DNA استخراج. بخش مورد نظر از DNA تکثير شده در آزمایشگاه و سپس ارسال برای "نسل بعدی" توالی نتیجه این است که--یک رکورد از تمام توالی DNA در نمونه--تغذیه به نرم افزار های کامپیوتری است که شمارش تعداد کپی از هر یک توالی و جستجو برای مسابقات آنلاین مرجع کتابخانه.

نیوجرسی مطالعه همكاري با Mishu و بیوانفورماتیک متخصص Zachary Charlop-قدرت شناسایی استخوانی و گونه های ماهی در مطابق الگوهای فصلی. و آنها دریافتند تعداد کمی از گونه حساب برای اکثریت بزرگی از DNA به دست آمده است.

تشخیص اشعه و سایر غضروفی گونه های دریایی در ضمن عمدتا محدود به ماه های گرم.

در علاوه بر این به زور زدن آن مواد ژنتیکی از آب محققان با استفاده از DNA برای شناسایی پوسیده باقی مانده از یک برزیل cownose ری شسته شده در نمونه منطقه در ماه اوت سال 2017.

محققان همچنین به اضافه جهانی در حال رشد پایگاه داده اولین DNA توالی مرجع برای 31 منطقه ای گونه شناسه توسط نیوجرسی دانشمندان از ترال نظرسنجی بیش از 30 سال گذشته.

دکتر Stoeckle را در مطالعات قبلی از نیویورک شرق و رودخانه هادسون نشان داد که حضور یا عدم حضور چند کلید گونه های ماهی عبور از آن آب. آمار هفتگی فوری ایجاد یک تصویر در حال حرکت است که تا حد زیادی تقویت شده و در ارتباط با دانش از سال, تور ماهیگیری, trawls.

با انجام یک سری از آزمایشات در طول زمان کار پیشگام رمان راه به رکورد ماهی مهاجرت. ادنا یک گلدیلاک کیفیت درست و مناسب برای تحقیقات دکتر Stoeckle یادداشت: اگر از آن ناپدید شد بیش از حد سرعت نمونه برداری نمی خواهد به ما بگویید که اگر آن درنگ بیش از حد مقدار DNA خواهد بود در آب تضعیف مفید و به موقع بینش.

مراحل بعدی عبارتند از تنظیم خوب کالیبراسیون مقایسه ادنا "می خواند" و نتایج با داده های سنتی از بررسی های انجام شده با شبکه و سونار. فراموش 100 DNA "خوانده شده" نشان می دهد حضور 1 ماهی یا 10 ماهی ؟

همچنین تعیین می شود: نرخ که در آن ماهی های مختلف و دیگر گونه های دریایی ریختن DNA.

###

http://www.راکفلر.edu/در مورد

phe.rockefeller.edu

حمایت از علوم و فنون دریایی و ابتکار سیاست از این برنامه برای محیط زیست انسانی (در دانشگاه راکفلر) و شهری ساحل موسسه (Monmouth University) از آغاز کار بر روی آبزیان DNA.

https://phe.راکفلر.edu/بارکد/وبلاگ/nycnj-آبزیان-مهره داران-ادنا-پروژه/

عکس از نمونه کلید جداول: https://bit.ly/3coA8rG

اعتبار: علامت Stoeckle این دانشگاه راکفلر

دیگر تصاویر و جداول مورد استفاده در مقاله (https://bit.ly/2WD6OXE) نیز در دسترس هستند در صورت درخواست