Multiomics تحقیقات آشکار ویژگی های HIV-1-سلول های آلوده در vivo

برای ریشه کن کردن HIV-1, مهم است که به بررسی دقیق ویژگی ها و ناهمگونی از HIV-1-سلول های آلوده در بدن ، در این مطالعه سلول های بنیادی خونساز-پیوند انسانی مدل موش مبتلا به یک ژن اصلاح شده HIV-1 مورد استفاده قرار گرفت به فاش کردن چند ویژگی از HIV-1-تولید سلول های in vivo.

یک گروه تحقیقاتی در موسسه علوم پزشکی دانشگاه توکیو (IMSUT) با استفاده از HIV-1-سلول های آلوده انجام می شود "multiomics" تجزیه و تحلیل است که فن آوری های به تازگی توسعه یافته را به طور جامع بررسی ویژگی های نمونه های بیولوژیکی.

"یافته های ما توصیف های متعدد فنی HIV-1-تولید سلول ها در داخل بدن است که می تواند به ارائه سرنخ برای توسعه HIV-1 درمان است.", گفت: رهبری دانشمند کی ساتو, دانشیار (محقق اصلی) در بخش سیستم های ویروس شناسی, گروه بیماری های عفونی کنترل IMSUT.

نتایج حاصل از این پژوهش منتشر شده در سلول گزارش در 14 ژوئیه سال 2020 است.

برای ریشه کن کردن HIV-1, مهم است که برای به دست آوردن درک عمیق از گسترده فنی HIV-1-سلول های آلوده در بدن ،

به تازگی توسعه یافته 'omics' تجزیه و تحلیل (*1) می تواند یک ابزار قدرتمند برای شناسایی ویژگی های HIV-1-سلول های آلوده. با این حال باید توجه داشت که اکثریت زیادی از سلول های CD4+ T(*2) در افراد آلوده هستند مثلا و بنابراین رونويسی پروفایل "فله" سلول های CD4+ T in vivo را منعکس نمی کند کسانی که از "خالص" HIV-1-تولید سلول.

Multiomics تجزیه و تحلیل را به طور جامع نشان می دهد ویژگی های از HIV-1-سلول های آلوده در شرايط in vivo

در این مطالعه گروه تحقیقاتی با استفاده از یک انسان سلول بنيادی خون ساز-پیوند انسانی مدل موش که حفظ انسان leukopoiesis تحت نسبتا پایدار ایمنی در شرایط in vivo و تکرار-صالح خبرنگار HIV-1 و با استفاده از چهار اخیرا تکنیک های توسعه یافته به بررسی ویروسی ژنتیک و transcriptomics.

به گفته این گروه تحقیقاتی این مطالعه شامل چهار زیر تجزیه و تحلیل:

اولین قطرات دیجیتال PCR نشان داد حضور بالقوه در مخازن آلوده انسانی موش. دوم بستن واسطه PCR نشان داد اولویت HIV-1 به ادغام باز کروماتین مناطق به عنوان پیشنهاد شده توسط انجمن از تغییرات اپی ژنتیک از ادغام سایت های ویروسی تولید. سوم دیجیتال RNA-توالی مقدار مطلق تعداد کپی از ویروسی متن در اچ آی وی-1-تولید سلول ها در داخل بدن و بیشتر شناسایی differentially بیان ژن بین ویروس آلوده و مثلا سلول. در نهایت تک سلول RNA-تعیین توالی نشان داد و مشخص ناهمگونی از HIV-1-تولید سلول های in vivo.

دانشیار ساتو تاکید کرد "به دانش ما در این مطالعه اولین تحقیق برای توصیف جنبه های متعدد از HIV-1-سلول های تولید و همچنین اولین تحقیق جامع از ویژگی های HIV-1-سلول های آلوده در vivo" .

###

برای جزئیات بیشتر به تحقیق و مراجعه کنید به مقاله.

زمینه مطالعه علمی است که با هدف به صورت جامع مشخص و تعیین ویژگی های نمونه های بیولوژیکی. ترکیبی از چند بیولوژیکی "-ome" اطلاعات دسته بندی (به عنوان مثال ژنوم و transcriptome).

ایمنی بدن سلول های زیر مجموعه که orchestrates به دست آورد پاسخ ایمنی است.

Hirofumi Aso#, Shumpei ناگائوکا#, Eiryo Sprayberry#, Jumpei Ito Saiful Islam, Benjy Jek یانگ قهوهای مایل به زرد شینجی Nakaoka, کویچی Ashizaki, Katsuyuki Shiroguchi, Yutaka سوزوکی Yorifumi Satou, Yoshio Koyanagi Kei ساتو* "Multiomics تحقیقات آشکار ویژگی های HIV-1-سلول های آلوده در vivo"همراه گزارش

# به همان اندازه کمک کرده است. *مکاتبات.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.107887

این مطالعه با پشتیبانی در بخش AMED J-غرور (19fm0208006h0003 به کی ساتو), KAKENHI علمی پژوهشی B (18H02662 به کی ساتو), KAKENHI تحقیقات علمی در ابتکاری مناطق "Neovirology" (16H06429, 16K21723, 17H05813, 19H04826 به کی ساتو), JST تاج (به کی ساتو), JSPS KAKENHI PAGS 16H06279 (به K. ساتو), AMED برنامه های تحقیقاتی در زمینه اچ آی وی/ایدز 19fk0410014 (19fk0410014, 19fk0410019 به Yoshio Koyanagi و کی ساتو) و JSPS محقق (PD 19J01713 به Jumpei Ito).

سلب مسئولیت: AAAS و EurekAlert! مسئول صحت اخبار منتشر شده به EurekAlert! با کمک موسسات و یا برای استفاده از هر گونه اطلاعات از طریق EurekAlert سیستم.